Genotoul-bioinfo

SIGNIFICATION

Les domaines d’expertise de la plateforme GenoToul bioinfo sont :
le traitement des données issues du séquençage haut débit : assemblage, annotation, analyse d’expression (RNAseq, RNAseq de novo, sRNAseq), métagénomique, analyse de variants, méthylSeq.
l’analyse bioinformatique des ARNnc : annotation, prédiction, recherche de cibles, chez les archae, les bactéries, les plantes et les animaux.

Thèmes associés :
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Vocabulaire Connexe :

  1. URGI : L’activité de recherche de l’URGI (intégration de données, annotation des répétitions, structure et dynamique des génomes) est étroitement liée aux 2 composantes de la plateforme (Système d’Information et analyse des génomes). D’une part, la plateforme bénéficie...
  2. iCONICS : L’Institut du Cerveau et de la Moelle épinière (ICM), situé sur le site de l’Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, constitue un pôle majeur de recherche fondamentale et clinique sur le système nerveux, où 650 chercheurs, ingénieurs et médecins couvrent...
  3. CBiB : L’objectif du Centre de Bioinformatique de Bordeaux (CBiB) est de concevoir, mettre en œuvre et fournir l’accès aux services d’analyse de données biologiques adaptés à une production à haut débit (ex., génomique, protéomique, métabolomique, etc.). Cette...
  4. MMG-GBIT : Expertise dans le domaine des maladies rares de la recherche au traitement : Design et analyse des expériences de séquençage (WES, WGS, RNAseq, CHIPseq) Recherche de nouveaux gènes par analyses familiales Analyse des données Création et...
  5. EBIO : La plateforme Bioinformatique eBio (http://ebio.u-psud.fr/), créée en décembre 2009, est au centre du dispositif de bioinformatique de l’Université Paris-Sud. Elle est associée aux services de bioinformatiques de l’INRA Moulon, de l’hôpital Paul Brousse et de Gustave...
  6. TAGC-BCF : The expertise of the TAGC-BCF s’articulent autour de la génomique et la bioinformatique appliquées à l’étude des pathologies. Notre approche est multidisciplinaire et s’appuie sur la biologie des systèmes. Nos domaines d’expertise sont notamment: l’analyse de données...
  7. INCa-SLC : Cette structure a été créée à l’initiative de l’INCa dans le cadre de sa participation à l' »International  Cancer Genome Consortium » (ICGC).   Elle a trois missions : 1 collecter ou préparer puis valider les acides nucléiques (ADN...
  8. MIGALE : La plate-forme MIGALE a une interaction privilégiée avec l’équipe StatInfOmics de l ‘unité MaIAGE à qui elle fournit un support logistique important. Les compétences de cette équipe sont les statistiques appliquées à l’analyse des données « omiques...
  9. AuBi : La plateforme fait apparaître une forte expertise en génomique, épigénomique et métagénomique. Les modèles biologiques sont variés (micro-organismes, plantes, animaux) donnant un caractère généraliste à de nombreux outils. Cette plate-forme fait suite à une structuration des...
  10. GenAtlas : GENATLAS, http//:www.genatlas.org                                                                                 GENATLAS est une base de données sur les gènes et les maladies, créée en 1986 et depuis  constamment mise à jour ; elle met à disposition de la communauté scientifique et médicale internationale des...