● Bioanalyses
Conception, définition de design expérimentaux en génomique (microarrays, NGS). Analyse de données génomiques (microarray et NGS)
– Microarray :
– Gene Expression (Agilent, Affymetrix)
– CGH array
– microRNA array
– NGS (DNA-seq):
– Détection de SNP (WES, WGS, TS)
– Détection de variants structuraux (LOH, CNV)
– ChipSeq
– NGS (RNA-seq) :
– Analyse différentielle
– recherche de transcrit de fusion
– recherche de splicing alternatif
– detection de SNP par RNA-seq
● Conseil / Support
Elaboration de cahier des charges pour des projets de recherche à composante « bioinformatique » : définition du projet bioinformatique, définition des compétences requises, rédaction de fiche de poste, recrutement de bioinformaticien, estimation du coût global. La plateforme peut se positionner en partenaire du projet ou en prestataire de service.
● Formations
Organisation de formations généraliste en interne. Organisation de formations spécifiques, sur demande, dans les locaux des demandeurs (utilisation d’un logiciel, explication de méthodologie bioinformatique, statistiques)
● R&D
Développement /Maintenance de pipelines d’analyse.
Développement à facon d’outils d’annotation / de visualisation de données NGS Développement de DB de données génomiques
Participation au developpement de DB en médecine personnalisée
