La plate-forme MIGALE a une interaction privilégiée avec l’équipe StatInfOmics de l ‘unité MaIAGE à qui elle fournit un support logistique important. Les compétences de cette équipe sont les statistiques appliquées à l’analyse des données « omiques », et la bioinformatique au sens large, concernant en particulier :
la structure des génomes :
traitement et analyse des données NGS
l’annotation structurale et fonctionnelle de génomes complets,
la recherche de motifs dans les séquences ou les réseaux
la transcriptomique :
l’annotation structurale des ANR messagers
l’analyse des régulations
la structure et fonction des protéines :
classification et analyse des structures 3D des protéines
modélisation de la structure 3D des protéines
analyse des relations structure 3D – fonction des protéines
la génomique évolutive
comparaison de génomes microbiens
étude des processus évolutifs
Les autres équipes de l’unité ont des compétences :
en biologie des systèmes
biologie des systèmes pour les procaryotes (B. subtilis)
modélisation et analyse de réseaux de régulation biologique
en extraction de connaissances à partir de textes scientifiques appliquée
à la modélisation des réseaux de régulation génique et du métabolisme,
à la relation génotype-phénotype,
aux phénotypes multi-espèce et à l’adaptation à l’environnement.
