Génomique procaryote et virale. Transcriptomique. Métagénomique. Protéomique. Biologie Structurale (EM and X-ray crystallography)
PACA-Bioinfo
SIGNIFICATION
Vocabulaire Connexe :
- BIstrO : • Biologie Végétale Intégrative (silencing, épigénétique, intéractions hôtes pathogènes, cycle cellulaire, …) • Maladies génétiques rares (ciliopathies, rétinopathies, myopathies, …) • Génomique structurale, fonctionnelle, comparative • Protéomique haut-débit et Protéomique structurale • Développement de méthodes quantitatives...
- MIGALE : La plate-forme MIGALE a une interaction privilégiée avec l’équipe StatInfOmics de l ‘unité MaIAGE à qui elle fournit un support logistique important. Les compétences de cette équipe sont les statistiques appliquées à l’analyse des données « omiques...
- BiRD : La plateforme BiRD conseille, propose et développe des services en bioinformatique : analyse de données de séquençage et génotypage à haut débit pour la détection de variants, étude du transcriptome (RNA-Seq et puces à ADN). Pour...
- PRABI-Lyon-Gerland : Le PRABI-Gerland https://prabi.ibcp.fr localisé à l’IBCP développe les bases de données dans le domaine infectieux, les méthodes de prédiction et d’optimisation des structures 3D de protéines ainsi que les outils et services s’y rapportant. Dans le domaine des...
- MicroScope : Développement de méthodes et d’outils destinés à l’annotation, à la génomique et au métabolisme comparatifs de génomes bactériens. Organisation et gestion de données génomiques et métaboliques dans des structures de bases de données. Prédiction et analyse...
- PRABI-AMSB : Les domaines de compétences du PRABI-AMSB comprennent la phylogénie moléculaire, les statistiques, l’écologie, la virologie et la microbiologie ainsi que l’analyse de données biomédicales. Par ailleurs les méthodologies utilisées sont celles de la génomique, la transcriptomique,...
- CBiB : L’objectif du Centre de Bioinformatique de Bordeaux (CBiB) est de concevoir, mettre en œuvre et fournir l’accès aux services d’analyse de données biologiques adaptés à une production à haut débit (ex., génomique, protéomique, métabolomique, etc.). Cette...
- INCa-SLC : Cette structure a été créée à l’initiative de l’INCa dans le cadre de sa participation à l' »International Cancer Genome Consortium » (ICGC). Elle a trois missions : 1 collecter ou préparer puis valider les acides nucléiques (ADN...
- AuBi : La plateforme fait apparaître une forte expertise en génomique, épigénomique et métagénomique. Les modèles biologiques sont variés (micro-organismes, plantes, animaux) donnant un caractère généraliste à de nombreux outils. Cette plate-forme fait suite à une structuration des...
- URGI : L’activité de recherche de l’URGI (intégration de données, annotation des répétitions, structure et dynamique des génomes) est étroitement liée aux 2 composantes de la plateforme (Système d’Information et analyse des génomes). D’une part, la plateforme bénéficie...
